Universidade de São Paulo Superintendência da Tecnologia da Informação Computação de Alto Desempenho
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Lince

LINCE – Cluster Linux

 

Características

O Cluster Lince é constituido por 32 servidores, cada um com 16 Cores Intel(R) Xeon(R) E7- 2870 @ 2.40GHz, 2 placas Tesla K20m e 129 GB RAM. Completa o cluster um Filesystem com 55 TB para arquivos temporarios.

 

Sistema de Filas

torquePBS + Maui (escalonador)

Informações Úteis

Os seguintes comandos são úteis:

  • qstat -a (visualizar todos os jobs presentes no servidor)
  • qstat -q (exibir as filas existentes)
  • showq (situação dos jobs na fila)

 

Em /opt/intel/ serão encontrados os compiladores intel.

 

Grave todos os seus arquivos em /scracth/seu_login. Execute todos seus jobs a partir de diretórios dentro de /scracth/seu_login

 

Foi criado um RamDisk no filesystem /dev/shm com 270 GB de Ram. Crie um diretório neste filesystem para gerar arquivos de saída para um melhor desempenho do seu programa.

 

Os codigos paralelos, aqueles que rodarão com mpirun no sistema de filas, deverão ser compilados com os compiladores “paralelos” correspondentes. Isto é, mpicc para C e mpif90 para fortran90.

 

Para alterar a senha utilizem “yppasswd”.