Universidade de São Paulo Superintendência da Tecnologia da Informação Computação de Alto Desempenho
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Produção Científica

Produção Científica

Artigos em Congressos / Conferências

M. A. Souza, H. Myake, Search for α + core states in even-even Cr isotopes, Eur. Phys. J. A (2017) 53: 146, DOI 10.1140/epja/i2017-12339-9

Y. Seminovski, P. Tereshchuk, A. Kiejna, J. L. F. Da Silva, The Role of the Cationic Pt Sites in the Adsorption Properties of Water and Ethanol on the Pt4/Pt(111) and Pt4 /CeO2 (111) Substrates: A Density Functional Theory Investigation, 9th Brazilian-German Workshop on Applied Surface Science, Maresias, Sao Sebastiao, SP, 2016

Y. Seminovski, P. Tereshchuk, A. Kiejna, J. L. F. Da Silva, Adsorption Properties of Water and Ethanol on Pt4/CeO2(111): A DFT+U Investigation, III IQSC Workshop on Theoretical Chemistry, SP, 2015

Y. Seminovski, P. Tereshchuk, A. Kiejna, J. L. F. Da Silva, DFT Investigation of Water Adsorption on the Pt4/CeO2(111) substrate, Workshop Density Functional Theory meets Quantum Information Theory, Araraquara, 2014

Y. Seminovski, P. Tereshchuk, J. L. F. Da Silva, Quantum Theory Calculations of Supported and Unsupported Transition-Metal Clusters, Workshop de High Performance Computing Convênio: USP Rice University , SP, 2015.

Rosset, L. M.; Nardin, L. G. & Sichman, J. S. Use of high performance computing in agent-based social simulation: A case study on trust-based coalition formation Anais do VII Workshop-Escola de Sistemas de Agentes, seus Ambientes e apliCações (WESAAC’13), 2013, 161-163

Rosset, L. M.; Nardin, L. G. & Sichman, J. S. Simulação de parcerias entre agentes autônomos Anais do 21o Simpósio Internacional de Iniciação Científica (SIICUSP), Universidade de São Paulo, 2013

Cucchieri, Attilio; Dudal, David; Mendes , Tereza, e Vandersickel, Nele , Evidence of BRST-Symmetry Breaking in Lattice Minimal Landau Gauge , PoS LATTICE2014 (2015) 347

Cucchieri, Attilio e Mendes , Tereza, Crossing the Gribov horizon: an unconventional study of geometric properties of gauge-configuration space in Landau gauge, PoS LATTICE2013 (2014) 367 BRST

Vequi-Suplicy, C.C.; Rusu, V. H.; Lins, R. D.; Coutinho, K., Characterization of structural and electronic properties of 2’-palmitoyluridine (2UP) and 3’- palmitoyluridine (3UP) in vacuum and in solvents, apresentado na School on Computational Trends in Solvation and Transport in Liquids

L. T. Rangel and J.C. Setubal. Analysis of Proteobacteria Genomes Using Phylogenomic Networks. Poster apresentado no Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2012.

L.T. Rangel and J.C. Setubal. Horizontal Gene Transfer and Nitrogen Fixation Genes in Gamma- and Beta-proteobacteria. Poster apresentado no workshop RECOMB-CG, Lyon, França, 2012.

Artigos em Periódicos

Marcos Roberto Silva, Claudio B. Cunha, A tabu search heuristic for the uncapacitated single allocation p-hub maximal covering problem, European Journal of Operational Research 262 (2017) 954-965

A. C. H. Da Silva, J. L. F. Da Silva, and D. W. Franco, Nitroxyl as a Ligand in Ruthenium Tetraammine Systems: A Density Functional Theory Study, Dalton Transactions 45, 4907 (2016).

A. P. L. Batista, A. G. S. de Oliveira-Filho, S. E. Galembeck, N-heterocyclic olefins carboxylates: bonding and stabilizing effects, VI Simpósio de estrutura eletrônica e dinâmica molecular (SEEDMOL) 2016.

A. P. L. Batista, A. G. S. de Oliveira-Filho, S. E. Galembeck, Photophysics and bonding properties of trans-[RuCl(NO)(NH3)4]2+, Brazilian Meeting on Inorganic Chemistry (BMIC) 2016.

A. P. L. Batista, Y. A. Aoto, A. Köhn, A. G. S. de Oliveira-Filho, Coupled Cluster, Kohn–Sham Calculations or Experiment? A Benchmark Study of Diatomic Molecules Containing Transition Metals; submitted to J. Chem. Theory Comput. (2016).

A. S. Chaves, G. G. Rondina, M. J. Piotrowski, and J. L. F. Da Silva, Structural Formation of Binary PtCu Clusters: A Density Functional Theory Investigation, Computational Materials Science 98, 278 (2015).

A. S. Chaves, G. G. Rondina, M. J. Piotrowski, P. Tereshchuk, and J. L. F. Da Silva, The Role of Charge States in the Atomic Structure of Cun and Ptn (n = 2 – 14 Atoms) Clusters: A DFT Investigation, The Journal of Physical Chemistry A 118, 10813 (2014).

A. S. Chaves, M. J. Piotrowski, D. Guedes-Sobrinho, and J. L. F. Da Silva, Theoretical Investigation of the Adsorption Properties of CO, NO, and OH on Monometallic and Bimetallic 13-Atom Clusters: The Example of Cu13, Pt7 Cu6 , and Pt13, The Journal of Physical Chemistry A 119, 11565 (2015).

Attilio Cucchieri (Sao Paulo U., Sao Carlos), David Dudal (Gent U.), Tereza Mendes (Sao Paulo U., Sao Carlos), Nele Vandersickel (Gent U.), “BRST-Symmetry Breaking and Bose-Ghost Propagator in Lattice Minimal Landau Gauge. Phys.Rev. D90 (2014) no.5, 051501, 5 pp.

Attilio Cucchieri (Sao Paulo U., Sao Carlos), David Dudal (Leuven U. & Gent U.), Tereza Mendes (Sao Paulo U., Sao Carlos), Nele Vandersickel (Gent U.), “Evidence of BRST-Symmetry Breaking in Lattice Minimal Landau Gauge”,. PoS LATTICE2014 (2014) 347, 6pp.

Attilio Cucchieri (Sao Paulo U., Sao Carlos), Tereza Mendes (Sao Paulo U., Sao Carlos & Orsay, “Numerical Evaluation of the Bose-Ghost Propagator in Minimal Landau Gauge on the Lattice” LPT). Phys.Rev. D94 (2016) no.1, 014505, 13pp.

Attilio Cucchieri (Sao Paulo U., Sao Carlos), Tereza Mendes (Sao Paulo U., Sao Carlos), “Crossing the Gribov horizon: an unconventional study of geometric properties of gauge-configuration space in Landau gauge”. PoS LATTICE2013 (2014) 367, 7 pp.

Attilio Cucchieri (Sao Paulo U., Sao Carlos), Tereza Mendes (Sao Paulo U., Sao Carlos), “Ghost sector and geometry in minimal Landau gauge: further constraining the infinite-volume limit”. Phys.Rev. D88 (2013) 114501, 22 pp.

Azevedo, S. V., Carantona, O. A. M., Oliveira, T. L., Hartfelder, K., 2011. Differential expression of hypoxia pathway genes in honey bee (Apis mellifera L.) caste development J. Insect Physiol. 57, 38-45.

Basso, L. G. M., Fernandes, T. V. A., Lima, J. F., Crusca, E., Vicente, E. F., Cilli, E. M., Pascutti, P. G., Costa-Filho, A. J. The Conformational Flexibility of an Internal Fusion Peptide from Sars-Cov Spike Glycoprotein is Modulated by Lipid Membrane Composition. In: 58th Annual Meeting of the Biophysical Society, 2014, San Francisco. Biophysical Journal, 2014. v. 106. p. 295a

C. M. O. Bastos, F. P. Sabino, P. E. F. Junior, T. Campos, J. L. F. Da Silva, and G. M. Sipahi1, Stability and Accuracy Control of k·p Parameters, Semiconductors Science Technology 31, 105002 (2016).

C. R. C. Rego, L. N. Oliveira, P. Tereshchuk, and J. L. F. Da Silva, ˆ Erratum: Comparative Study of van der Waals Corrections to the Bulk Properties of Graphite [J. Phys.: Condens. Matter 27, 415502 (2015)], Journal of Physics: Condensed Matter 28, 129501 (2016).

C. R. C. Rego, L. N. Oliveira, P. Tereshchuk, and J. L. F. Da Silva, ˆ Comparative Study of van der Waals Corrections to the Bulk Properties of Graphite, Journal of Physics: Condensed Matter 27, 415502 (2015).

Carlos M. O. Bastos, Fernando P. Sabino, Paulo E. Faria Junior, Tiago Campos, Juarez L. F. Da Silva and Guilherme M. Sipahi. Stability and Accuracy Control of k·p Parameters. Semiconductor Science and Technology, 31, 105002 (2016).

D. Guedes-Sobrinho, R. K. Nomiyama, A. S. Chaves, M. J. Piotrowski, and J. L. F. Da Silva, Structure, Electronic, and Magnetic Properties of Binary PtnTM55 – n (TM = Fe, Co, Ni, Cu, Zn) Nanoclusters: A Density Functional Theory Investigation, Journal of Physical Chemistry C 119, 15669 (2015)

Dragone, G.N.; Ussami, N., Gimenez, M.E., Klinger, F.L. e Chaves, C.A.M. 2016, The geophysical signatures of the Rio Apa, Tebicuary and Rio de la Plata cratons and the Western Parana suture/shear zone: new constraints on the SW Gondwana amalgamation history, Precambrian Research.dx.doi.org/10.2147/CCID.S88485

F. P. Sabino, L. N. Oliveira, and J. L. F. Da Silva, Role of Atomic Radius and d-States Hybridization in the Stability of the Crystal Structure of M2 O3 (M = Al, Ga, In), Physical Review B 90, 155206 (2014).

F. P. Sabino, Luiz Nunes de Oliveira, Juarez L. F. Da Silva. Role of atomic radius and d-states hybridization in the stability of the crystal structure of M2O3 (M = Al, Ga, In) oxides. Physical Review B, 90, 155206 (2014)

F. P. Sabino, R. Besse, L. N. Oliveira, S.-H. Wei, and J. L. F. Da Silva, Origin of and Tuning the Optical and Fundamental Band Gaps in Transparent Conducting Oxides: The Case of M2 O3 (M = Al, Ga, In, Physical Review B 92, 205308 (2015)

F. S. Pablo, J. F. Gomes, A. A. Camilo, P. Tereshchuk, C. A. Martins, G. A. Camara, M. E. Martins, J. L. F. Da Silva, and G. Tremiliosi-Filho, Establishing a Link Between Well-Ordered Pt(100) Surfaces and Real Systems: How Do Random Superficial Defects Influence the Electro-oxidation of Glycerol?, ACS Catalysis 5, 4227 (2015).

Falcón, T., Nunes, F.M.F., Ferreira-Caliman, M.J., Teixeira, J.S.G., Tanaka, E.D., Nascimento, F.S., Bitondi, M.M.G., 2014. Exoskeleton formation in Apis mellifera: cuticular hydrocarbons profiles and expression of desaturase and elongase genes during pupal and adult development. Insect Biochem. Mol. Biol. 50, 68-81

Fernando P. Sabino, Rafael Besse, Luiz Nunes de Oliveira, Su-Huai Wei, Juarez L. F. Da Silva. Origin of and tuning the optical and fundamental band gaps in transparent conducting oxides: the case of M2O3 (M = Al, Ga, In). Physical Review B, 92, 205308 (2015).

Fontanari J F , “When more of the same is better”, Europhysics Letters, vol. 113, 28009 (2016) doi: 10.1209/0295-5075/113/28009

  • http://journals.aps.org/pre/abstract/10.1103/PhysRevE.93.052116
  • http://www.fmt.if.usp.br/~luisdias/publications.html

Humann, F. C., Tiberio, G. J., Hartfelder, K., 2013. Sequence and expression characteristics of long noncoding RNAs in honey bee caste development – poterntial regulatirs of transgressive ovary size. PLoS One 8, e78915.

J. Ma, J. Yang, S.-H. Wei, and J. L. F. Da Silva, Correlation Between the Electronic Structures and Diffusion Paths of Interstitial Defects in Semiconductors: The Case of CdTe, Physical Review B 90, 155208 (2014).

J. Mol. Struct. 2016, 1120, pp. 245-249 (10.1021/acs.jpcb.5b08446)

J. Phys. Chem. B, 2016, 120, pp 1660–1669 (10.1021/acs.jpcb.5b08446)

JE Padilha, A Fazzio, AJR da Silva, van der Waals heterostructure of phosphorene and graphene: Tuning the Schottky barrier and doping by electrostatic gating, Physical review letters 114 (6), 066803 54 2015

JE Padilha, LB Abdalla, AJR da Silva, A Fazzio, Fully and partially iodinated germanane as a platform f or the observation of the quantum spin Hall effect Physical Review B 93 (4), 045135 1 2016

JE Padilha, RB Pontes, Electronic and transport properties of structural defects in monolayer germanene: An ab initio investigation, Solid State Communications 225, 38-43 1 2016

JE Padilha, RB Pontes, TM Schmidt, RH Miwa, A Fazzio, A new class of large band gap quantum spin hall insulators: 2D fluorinated group-IV binary compounds Scientific reports 6 2016

K. E. A. Batista, M. J. Piotrowski, A. S. Chaves, and J. L. F. Da Silva, A Theoretical Investigation of the Structural and Electronic Properties of 55-Atom Nanoclusters: The Examples of Y–Tc and Pt, Journal of Chemical Physics 144, 054310 (2016).

Kapheim, K. M., Pan, H. L., Li, C., Salzberg, S. L., Puiu, D., Magoc, T., Robertson, H. M., Hudson, M. E., Venkat, A., Fischman, B. J., Hernandez, A., Yandell, M., Ence, D., Holt, C., Yocum, G. D., Kemp, W. P., Bosch, J., Waterhouse, R. M., Zdobnov, E. M., Stolle, E., Kraus, F. B., Helbing, S., Moritz, R. F. A., Glastad, K. M., Hunt, B. G., Goodisman, M. A. D., Hauser, F., Grimmelikhuijzen, C. J. P., Pinheiro, D. G., Nunes, F. M. F., Soares, M. P. M., Tanaka, E. D., Simoes, Z. L. P., Hartfelder, K., Evans, J. D., Barribeau, S. M., Johnson, R. M., Massey, J. H., Southey, B. R., Hasselmann, M., Hamacher, D., Biewer, M., Kent, C. F., Zayed, A., Blatti, C., Sinha, S., Johnston, J. S., Hanrahan, S. J., Kocher, S. D., Wang, J., Robinson, G. E., Zhang, G. J., 2015. Genomic signatures of evolutionary transitions from solitary to group living. Science 348, 1 139-1143.

L. Zibordi-Besse, P. Tereshchuk, A. S. Chaves, and J. L. F. Da Silva, Ethanol and Water Adsorption on Transition-Metal 13-Atom Clusters: A Density Functional Theory Investigation within van der Waals Corrections, Journal of Physical Chemistry A 120, 4231 (2016).

L.G. Rizzi e N.A. Alves , Comment on “Nature of Long-range order in stripe-forming systems with long-range repulsive interactions”, to appear in Physical Review Letters (2016).

L.G. Rizzi e N.A. Alves, Microcanonical thermostatistics of coarse-grained proteins with amyloidogenic propensity, Journal Chemical Physics, 138 (2013) 015102 2)

M. J. Piotrowski, P. Tereshchuk, and J. L. F. Da Silva, Theoretical Investigation of Small Transition-Metal Clusters Supported on the CeO2 (111) Surface, Journal of Physical Chemistry C 118, 21438 (2014).

M. RIBEIRO JR. and M. Marques, “Theoretical study of InN/GaN short period superlattices to mimic disordered alloys ”, Journal of Applied Physics 115, 223708 (2014).

M. RIBEIRO JR. and S. A. Shevlin, “Self-energy corrected ab initio simulation of the photo-catalytic material nitrogen-doped rutile TiO 2 ”, Science of Advanced Materials Volume 7, Number 4, 623-630 (2015).

M.A. Souza and H. Miyake, Physical Review C 91, 034320 (2015).

Martins, J. R., Anhezini, L., Dallacqua, R. P., Simões, Z. L. P., Bitondi, M. M. G., 2011. A honey bee hexamerin, HEX 70am is likely to play an intranuclear role in developing and mature ovarioles aand testioles. PLoS One 6, e29006. Mello, T. R. P., Aleixo, A. C., Pinheiro, D. G., Nunes, F. M. F., Bitondi, M. M. G., Hartfelder, K., Barchuk, A. R., Simões, Z. L. P., 2014. Developmental regulation of ecdysone receptor (EcR) and EcR-controlled gene expression during pharate-adult development of honeybees (Apis mellifera). Frontiers Genet. e445.

MAURO RIBEIRO JR., “ Ab initio quasi particle approximation bandgaps of silicon nanowires calculated at DFT/LDA computational effort”, Journal of Applied Physics, 117, 234302 (2015).

MAURO RIBEIRO JR., “ Empirical relation between Pauling electronegativity and self energy cutoffs in LDA–1/2 quasiparticle approach applied to the calculation of band gaps of binary compound semiconductors”, MRS Communications, 6, 99 103 (2016).

MAURO RIBEIRO JR., “Application of GGA 1/2 excited states correction method to p electrons defective states: the special case of nitrogen doped TiO_(2) ”, Canadian Journal of Physics 93, 261 266 (2015).

MAURO RIBEIRO, JR., “ Ab initio Energy Gap Calculations of ZnO Nanowires Based on LDA 1/2 Approach”, Nanoscience & Nanotechnology­Asia, 4, 124 131 (2014).

Nunes, F. M. F., Ihle, K. E., Mutti, N. S., Simões, Z. L. P., Amdam, G. V., 2013. The gene vitellogenin affects microRNA regulation in honey bee (Apis mellifera) fat body and brain. J. Exp. Biol. 216, 3724-23732. Organometallics, 2015, 34, 2463-2470 (10.1021/om5012038)

P. S. Fernandez, C. A. Angelucci, P. Tereshchukc, J. F. Gomes, A. C. Garci ´ a, C. A. Martins, G. A. Camara, M. E. Martins, J. L. F. Da Silva, M. T. M. Koperf, and G. Tremiliosi-Filho, How Do Random Superficial Defects Influence the ElectroOxidation of Glycerol on Pt(111) Surfaces?, Accepted for publication in the Physical Chemistry and Chemical Physics, 2016

P. Tereshchuk, A. S. Chaves, and J. L. F. Da Silva, Glycerol Adsorption on Platinum Surfaces: A Density Functional Theory Investigation with van der Waals Corrections, Journal of Physical Chemistry C 118, 15251 (2014). P. Tereshchuk, M. J. Piotrowski, and J. L. F. Da Silva, Atomic Structure of the La/Pt(111) and Ce/Pt(111) Surfaces Revealed by DFT+U Calculations, RSC Advances 5, 521 (2015).

P. Tereshchuk, R. C. Amaral, Y. Seminovski, J. L. F. Da Silva, The Role of van der Waals Correction on the Adsorption Properties of Glycerol on the Defected Pt(100) Surface, In Preparation.

P. Tereshchuk, R. L. H. Freire, and J. L. F. Da Silva, The Role of the CO Adsorption on Pt Monolayers Supported on Flat and Stepped Au Surfaces: A Density Functional Investigation, RSC Advances 4, 9247 (2014).

P. Tereshchuk, R. L. H. Freire, C. G. Ungureanu, Y. Seminovski, A. Kiejna, and J. L. F. Da Silva, The Role of Charge Transfer in the Oxidation State Change of Ce atoms in the TM13/CeO2 (111) Systems (TM = Pd, Ag, Pt, Au): A DFT+U Investigation, Physical Chemistry Chemical Physics 17, 13520 (2015).

Peres L R and Fontanari J F, “The nature of the continuous non-equilibrium phase transition of Axelrod’s model”, Europhysics Letters, vol. 111, 58001(2015) doi: 10.1209/0295-5075/111/58001

Phys. Rev. B 91, 115435 (2015)

Phys. Rev. B 94, 085425 (2016)

Pires et al. 2015. doi: 10.1098/rspb.2015.1952

R. Besse, F. P. Sabino, J. L. F. Da Silva, A Hybrid Density Functional Theory Investigation within van der Waals Corrections of the Chalcogenides Cs2MIIMIV 3 Q8 Family, Physical Review B 93, 165205 (2016).

R. C. Amaral, P. Tereshchuk, Y. Seminovski, J. L. F. Da Silva, The Role of Low-Coordinated Adsorption Sites on the Adsorption Properties of Glycerol on Defected Pt(111) Surface: A Density Functional Investigation within van der Waals Corrections, In Preparation.

R. L. H. Freire, A. Kiejna, and J. L. F. Da Silva, Adsorption of Water and Ethanol on Noble and Transition-Metal Substrates: A Density Functional Investigation within van der Waals Correctionsy, Accepted for publication in the Physical Chemistry and Chemical Physics, 2016.

R. L. H. Freire, A. Kiejna, and J. L. F. Da Silva, Adsorption of Rh, Pd, Ir, and Pt on the Au(111) and Cu(111) Surfaces: A Density Functional Theory Investigation, Journal of Physical Chemistry C 118, 19051 (2014).

R. L. H. Freire, A. Kiejna, and J. L. F. Da Silva, Erratum to Adsorption of Rh, Pd, Ir, and Pt on the Au(111) and Cu(111) Surfaces: A Density Functional Theory Investigation, Journal of Physical Chemistry C 119, 21744 (2015).

R. L. H. Freire,; Kiejna, Adam; Da Silva, Juarez L. F. Adsorption of Rh, Pd, Ir, and Pt on the Au(111) and Cu(111) Surfaces: A Density Functional Theory Investigation. Journal of Physical Chemistry C., v.118, p.19051-19061, 2014. DOI: 10.1021/jp5033228

R. L. H. Freire,; Kiejna, Adam; Da Silva, Juarez L. F. Adsorption of Water and Ethanol on Noble and Transition-Metal Substrates: A Density Functional Investigation within van der Waals Correction. Aceito para publicação na revista Physical Chemistry Chemical Physics.

Sadd, B. M., Barribeau, S. M., Bloch, G., de Graaf, D. C., Dearden, P., Elsik, C. G., Gadau, J., Grimmelikhuijzen, C. J. P., Hasselmann, M., Lozier, J. D., Robertson, H. M., Smagghe, G., Stolle, E., Van Vaerenbergh, M., Waterhouse, R. M., Bornberg-Bauer, E., Klasberg, S., Bennett, A. K., Caamara, F., Guigo, R., Hoff, K., Mariotti, M., Munoz-Torres, M., Murphy, T., Santesmasses, D., Amdam, G. V., Beckers, M., Beye, M., Biewer, M., Bitondi, M. M. G., Blaxter, M. L., Bourke, A. F. G., Brown, M. J. F., Buechel, S. D., Cameron, R., Cappelle, K., Carolan, J. C., Christiaens, O., Ciborowski, K. L., Clarke, D. F., Colgan, T. J., Collins, D. H., Cridge, A. G., Dalmay, T., Dreier, S., du Plessis, L., Duncan, E., Erler, S., Evans, J., Falcon, T., Flores, K., Freitas, F. C. P., Fuchikawa, T., Gempe, T., Hartfelder, K., Hauser, F., Helbing, S., Humann, F. C., Irvine, F., Jermiin, L. S., Johnson, C. E., Johnson, R. M., Jones, A. K., Kadowaki, T., Kidner, J. H., Koch, V., Kohler, A., Kraus, F. B., Lattorff, H. M. G., Leask, M., Lockett, G. A., Mallon, E. B., Antonio, D. S. M., Marxer, M., Meeus, I., Moritz, R. F. A., Nair, A., Napflin, K., Nissen, I., Niu, J., Nunes, F. M. F., Oakeshott, J. G., Osborne, A., Otte, M., Pinheiro, D. G., Rossie, N., Rueppell, O., Santos, C. G., Schmid-Hempel, R., Schmitt, B. D., Schulte, C., Simões, Z. L. P., Soares, M. P. M., Swevers, L., Winnebeck, E. C., Wolschin, F., Yu, N., Zdobnov, E. M., Aqrawi, P. K., Blankenburg, K. P., Coyle, M., Francisco, L., Hernandez, A. G., Holder, M., Hudson, M. E., Jackson, L., Jayaseelan, J., Joshi, V., Kovar, C., Lee, S. L., Mata, R., Mathew, T., Newsham, I. F., Ngo, R., Okwuonu, G., Pham, C., Pu, L. L., Saada, N., Santibanez, J., Simmons, D., Thornton, R., Venkat, A., Walden, K. K. O., Wu, Y. Q., Debyser, G., Devreese, B., Asher, C., Blommaert, J., Chipman, A. D., Chittka, L., Fouks, B., Liu, J., O’Neill, M. P., Sumner, S., Puiu, D., Qu, J., Salzberg, S. L., Scherer, S. E., Muzny, D. M., Richards, S., Robinson, G. E., Gibbs, R. A., Schmid-Hempel, P., Worley, K. C., 2015. The genomes of two key bumblebee species with primitive eusocial organization. Genome Biol. 16, e76.

Santos, D.E., Alberici, L.C., Hartfelder, K (2016) Mitochondrial structure and dynamics as critical factors in honey bee (Apis mellifera L.) caste development. Insect Biochem. Mol. Biol. 73, 1-11.

Souza, Roberto Molina; Achcar, Jorge Alberto ; Martinez, Edson Zangiacomi ; Mazucheli, Josmar . The use of asymmetric distributions in average bioequivalence. Statistics in Medicine (Print), v. 35, p. 2525-2542, 2016.

Theor. Chem. Acc. 2016, 135, pp 3-8 (10.1007/s00214-016-1946-1)

URO RIBEIRO JR., “Quasiparticle theoretical characterization of electronic and optical properties of the photocatalytic material Ti_(3 -d) O_(4) N”, Journal of Materials Research Vol. 30, No. 19 (2015).

Wallberg, A., Han, F., Wellhagen, G., Dahle, B., Kawata, M., Haddad, N., Simões, Z. L. P., Allsopp, M. H., Kandemir, I., de la Rúa, P., Pirk, C. W., Webster, M. T., 2014. A worldwide survey of genome sequence variation reveals the evolutionary history of the honeybee Apis mellifera Nat. Genet. 46, 1081-1088.

Y. Seminovski, P. Tereshchuk, A. Kiejna, J. L. F. Da Silva, The Role of the Cationic Pt Sites in the Adsorption Properties of Water and Ethanol on the Pt4 /Pt(111) and Pt4 /CeO2 (111) Substrates: A Density Functional Theory Investigation, accepted for publication in the Journal of Chemical Physics, 2016

Y. Seminovski, R. C. Amaral, P. Tereshchuk, J. L. F. Da Silva, Adsorption Properties of Water and Ethanol on defected Pt(111): A DFT Investigation within van der Waals Corrections, In Preparation.

CAMILLO, MARCOS H.M.; FANUCCHI, RODRIGO Z.; ROMERO, MARCEL E.V.; DE LIMA, TELMA WOERLE; DA SILVA SOARES, ANDERSON; BOTAZZO DELBEM, ALEXANDRE CLÁUDIO; MARQUES, LEANDRO TOLOMEU; MACIEL, CARLOS DIAS; AUGUSTO LONDON, JOÃO BOSCO Combining exhaustive search and multi-objective evolutionary algorithm for service restoration in large-scale distribution systems. Electric Power Systems Research (Print). Fator de Impacto(2015 JCR): 1,8090, v.134, p.1 – 8, 2016.

SOARES, T. W. L.; FEDERSON, F. M.; BOTAZZO DELBEM, ALEXANDRE CLÁUDIO; LONDON JR, J. B. A.; SOARES, A. S. Node-depth Phylogenetic-Based Encoding, a Spanning-Tree Representation for Evolutionary Algorithms. Part I: Proposal and Properties Analysis. Swarm and Evolutionary Computation. , v.X, p.1 – 23, 2016.

SOARES, A. S.; COELHO, C. J.; Delbem, A.C.B.; PAULA, L. C. M.; G. FILHO, A. R.; MARTINS, W. Parallel regressions for variable selection using GPU. Computing (Wien. Print). Fator de Impacto(2015 JCR): 0,8720, v.., p.. – , 2016. MARTINS, J. P.; Delbem, A.C.B. Pairwise independence and its impact on Estimation of Distribution Algorithms. Swarm and Evolutionary Computation. , p.80 – 96, 2015.

PAULA, L. C. M.; SOARES, A. S.; COELHO, C. J.; FILHO, A.; DELBEM, A. C. B. A GPU-Based Implementation of the Firefly Algorithm for Variable Selection in Multivariate Calibration Problems. Plos One. Fator de Impacto(2015 JCR): 3,0570, v.9, p.e114145 – , 2014.

GOIS, M. M.; MATIAS, P.; PERINA, A. B.; BONATO, V.; Delbem, A C B A Parallel Hardware Architecture based on Node-Depth Encoding to Solve Network Design Problems. International Journal of Natural Computing Research. , v.4, p.54 – 75, 2014.

PRADO, RICARDO S.; PEDROSA SILVA, RODRIGO C.; NETO, ORIANE M.; GUIMAR AES, FREDERICO G.; SANCHES, DANILO SIPOLI; A. LONDON, J O AO BOSCO; Delbem, Alexandre C.B. Differential Evolution Using Ancestor Tree for Service Restoration in Power Distribution Systems. Applied Soft Computing (Print). Fator de Impacto(2015 JCR): 2,8570, v.23, p.498 – 508, 2014.

MARTINS, J. P.; DELBEM, A. C. B. Efficiency enhancement of estimation of distribution algorithms by a compressed tournament selection. Journal of Intelligent & Fuzzy Systems. Fator de Impacto(2015 JCR): 1,0040, v.26, p.2537 – 2545, 2014.

VARGAS, D. V.; MURATA, J.; TAKANO, H.; Delbem, A C B General Subpopulation Framework and Taming the Conflict Inside Populations. Evolutionary Computation. Fator de Impacto(2015 JCR): 3,6000, v.1, p.140117105338000 – , 2014.

SANCHES, D. S.; LONDON JR, J. B. A.; Delbem, A C B Multi-Objective Evolutionary Algorithm for single and multiple fault service restoration in large-scale distribution systems. Electric Power Systems Research (Print). Fator de Impacto(2015 JCR): 1,8090, v.110, p.144 – 153, 2014.

FACCIOLI, R.; BORTOT, L. O.; Delbem, A C B Multi-Objective Evolutionary Algorithm NSGA-II for Protein Structure Prediction using Structural and Energetic Properties. International Journal of Natural Computing Research. , v.4, p.43 – 53, 2014.

SANCHES, DANILO SIPOLI; LONDON, JOÃO BOSCO A.; DELBEM, ALEXANDRE CLÁUDIO B.; PRADO, RICARDO S.; GUIMARÃES, FREDERICO G.; NETO, ORIANE M.; DE LIMA, TELMA W. Multiobjective evolutionary algorithm with a discrete differential mutation operator developed for service restoration in distribution systems. International Journal of Electrical Power & Energy Systems. Fator de Impacto (2015 JCR): 2,5870, v.62, p.700 – 711, 2014.

MARTINS, J. P.; FONSECA, CARLOS M.; DELBEM, A. C. B. On the Performance of Linkage-tree Genetic Algorithms for the Multidimensional Knapsack Problem. Neurocomputing (Amsterdam). Fator de Impacto(2015 JCR): 2,3920, v.1, p.1 – 45, 2014.

PAULA, L. C. M.; SOARES, A. S.; SOARES, T. W. L.; Delbem, A C B; COELHO, C. J.; G. FILHO, A. R. Parallelization of a Modified Firefly Algorithm using GPU for Variable Selection in a Multivariate Calibration Problem. International Journal of Natural Computing Research. , v.4, p.31 – 42, 2014.

KHOURY, G.; LIWO, A.; KHATIB, F.; ZHOU, H.; CHOPRA, G.; BACARDIT, J.; BORTOT, L. O.; FACCIOLI, R. A.; DENG, X.; HE, Y.; KRUPA, P.; LI, J.; MOZOLEWSKA, M. A.; SIERADZAN, A. K.; SMADBECK, J.; WIRECKI, T.; COOPER, S.; FLATTEN, J.; XU, K.; BAKER, D.; CHENG, J.; Alexandre C.B. Delbem; FLOUDAS, C. A.; KEASAR, C.; LEVITT, M.; POPOVIC, Z.; SCHERAGA, H. A.; SKOLNICK, J.; CRIVELLI, S. N. WeFold: A Coopetition for Protein Structure Prediction. Proteins (Print). Fator de Impacto(2015 JCR): 2,4990, v.1, p.n/a – n/a, 2014.

TOLEDO, C. F. M.; ARANTES, M. S.; OLIVEIRA, R. R. R.; Delbem, A C B A hybrid cGA applied to the MLCLSP with overtime. Applied Computing Review. , v.13, p.7 – 16, 2013.

DELBEM, A. C. B.; SILVA, R. P. M.; COURY, D. V.; DELBEM, A. C. B. Evolutionary Computation Techniques Applied to Phasor Measurement Unit Design. Journal of Control, Automation and Electrical Systems. , v.24, p.573 – 583, 2013.

DELBEM, A. C. B.; SILVA, R. P. M.; DELBEM, A. C. B.; COURY, D. V. Genetic algorithms applied to phasor estimation and frequency tracking in PMU development. International Journal of Electrical Power & Energy Systems. Fator de Impacto(2015 JCR): 2,5870, v.44, p.921 – 929, 2013.

BRASIL, C. R. S.; Delbem, A C B; SILVA, F. L. B. Multiobjective evolutionary algorithm with many tables for purely ab initio protein structure prediction. Journal of Computational Chemistry. Fator de Impacto(2015 JCR): 3,6480, v.1, p.11 – , 2013.

DELBEM, A. C. B.; GABRIEL, P. H. R.; Melo, V. V. de Algoritmos evolutivos e modelo HP para predição de estruturas de proteínas. Controle & Automação (Impresso). , p.25 – 37, 2012.

CROCOMO, M. K.; MARTINS, J. P.; Delbem, A.C.B. Decomposition of Black-Box Optimization Problems by Community Detection in Bayesian Networks. International Journal of Natural Computing Research. , v.3, p.1 – 19, 2012.

DELBEM, A. C. B.; DELBEM, A. C. B.; LIMA, T. W. DE; TELLES, G. P. Efficient Forest Data Structure for Evolutionary Algorithms Applied to Network Design. IEEE Transactions on Evolutionary Computation. Fator de Impacto(2015 JCR): 5,9080, v.PP, p.1 – 28, 2012.

BONETTI, DANIEL R.F.; Delbem, Alexandre C.B.; TRAVIESO, GONZALO; DE SOUZA, PAULO SERGIO L. Enhanced Van der Waals calculations in genetic algorithms for protein structure prediction. Concurrency and Computation. Fator de Impacto(2015 JCR): 0,9420, v.25, p.n/a – n/a, 2012.

DELBEM, A. C. B.; COURY, D. V.; DELBEM, A. C. B.; CARVALHO, J. R.; OLESKOVICZ, M.; SIMÕES, E. V.; BARBOSA, D.; SILVA, T. V. Frequency Estimation Using a Genetic Algorithm With Regularization Implemented in FPGAs. IEEE Transactions on Smart Grid. Fator de Impacto(2015 JCR): 3,1900, v.3, p.1353 – 1361, 2012.

de Melo, Vinícius Veloso; Botazzo Delbem, Alexandre Cláudio; DELBEM, A. C. B.; DELBEM, A. C. B. Investigating Smart Sampling as a population initialization method for Differential Evolution in continuous problems. Information Sciences. Fator de Impacto (2015 JCR): 3,3640, v.193, p.36 – 53, 2012.

DELBEM, A. C. B.; COURY, D. V.; OLESKOVICZ, M.; SIMÕES, E. V.; BARBOSA, D.; CARVALHO, J. R. Algoritmo evolutivo para a estimação da frequência em sistemas elétricos utilizando FPGAS. Controle & Automação (Impresso). , p.595 – 505, 2011.

PIERETI, S. A. R.; LONDON Jr., J.B. A.; DELBEM, A. C. B.; LONDON Jr., J.B. A.; BRETAS, N. G. Configurador de Redes baseado na Representação Nó Profundidade para efeito de Estimação de Estados: Simulação com os Sistemas de 6 e 14 barras do IEEE. Sinergia (CEFETSP). , v.12, p.23 – 36, 2011.

DELBEM, A. C. B.; MELO, V. V.; VARGAS, D. V.; CROCOMO, M. K. Phylogenetic Differential Evolution. International Journal of Natural Computing Research. , v.2, p.21 – 38, 2011.

Santos, A. C.; DELBEM, A. C. B.; London, Jr., J. B. A.; LONDON Jr., J.B. A.; BRETAS, N. G. Node-Depth Encoding and Multiobjective Evolutionary Algorithm Applied to Large-Scale Distribution System Reconfiguration. IEEE Transactions on Power Systems. Fator de Impacto(2015 JCR): 3,3420, v.25, p.1254 – 1265, 2010.

MONACO, F. J.; DELBEM, A. C. B.; FEDERSON, F. M. Genetic algorithm for the determination of linear viscoelastic relaxation spectrum from experimental data. Journal of Applied Polymer Science (Print). Fator de Impacto(2015 JCR): 1,8660, v.113, p.122 – 135, 2009.

DELBEM, A. C. B.; CANCINO, W. Inferring Phylogenies by Multi-objective Evolutionary Algorithms. International Journal of Information Technology and Intelligent Computing. , v.2, p.1 – 26, 2007.

Cucchieri, Attilio; Mendes, Tereza, Ghost sector and geometry in minimal Landau gauge: further constraining the infinite-volume limit, Phys.Rev. D88 (2013) 114501, 22 pags.

Eleno, Luiz T.F.; Errico, Leonardo A.; Gonzales-Ormeño, Pablo G.; Petrilli, Helena M.; Schön, Cláudio G. Ordering phase relationships in ternary iron aluminides. Calphad 44 (2013) 70.

Gustavo G. Rondina and Juarez L. F. Da Silva, Revised Basin Hopping Monte Carlo Algorithm for Structure Optimization of Clusters and Nanoparticles, dx.doi.org/10.1021/ci400224z | J. Chem. Inf. Model. 2013, 53, 2282-2298.

L.F. Martins, L. P. Antunes, R.C. Pascon, J.C. Franco de Oliveira, L.A. Digiampietri, D. Barbosa, B.M. Peixoto, M.A. Vallim, C. Viana-Niero, E.H. Ostroski, G.P. Telles, Z. Dias, J.B. da Cruz, L. Juliano, S. Verjovski-Almeida, A.M. da Silva, J.C. Setubal. Metagenomic analysis of a tropical composting operation at the São Paulo Zoo Park reveals diversity of biomass degradation functions and organisms. PLoS ONE, 8(4):e61928, 2013.

Rondina, G. G.; Da Silva, J. L. F. Revised Basin-Hopping Monte Carlo algorithm for structure optimization of clusters and nanoparticles. Journal of Chemical Information and Modeling, v. 53, n. 9, p. 2282–2298, 2013. Symmetry Breaking and Bose-Ghost Propagator in Lattice Minimal Landau Gauge Attilio Cucchieri, David Dudal, Tereza Mendes e Nele Vandersickel Phys. Rev. D90 (2014), 051501(R)

Iniciação Científica

Trabalho de iniciação científica da estudante Jacy Ellen Guimarães Silva

Dissertações de Mestrado

Estudo de primeiros princípios da adsorção de água e de etanol sobre ligas de superfície de metais de transição sob efeitos de deformação expansiva e compressiva.

Qualificação do Mestrado da estudante Thaícia Stona de Almeida

Qualificação FMUSP: Estudo Genético Quantitativo das propriedades básicas da pele

Em andamento – início 2015 Nome: Stella Granatto Justo; Título: Estudo da Formação de Estruturas Core-Shell de Metais de Transição; Instituição de origem: ˜ Instituto de Química de São Carlos, Universidade de São Paulo; Bolsa: CNPq.

Concluído – início 2013 Nome: Henrique Musseli Cesar; Título: Implementação do Método Parallel Tempering Monte Carlo para o Estudo de Propriedades Termodinâmicas de Nanoclusters; Instituição de origem: Instituto de Física de São Carlos, Universidade de São Paulo; Bolsa: FAPESP.

Concluído – início 2013 Nome: Larissa Zibordi Besse; Título: Estudo da Adsorção de Hidroxila, agua e Etanol sobre Clusters de Metais de Transição com 13 Atomo; sInstituição de origem: Instituto de Química de São Carlos, Universidade de São Paulo; Bolsa: CAPES.

Alexandre Defelicibus, Koala: sistema para integração de métodos de predição e análise de estruturas de proteína, Mestrado, 2016

Daniel Rodrigo Ferraz Bonetti, Aumento da eficiência do cálculo da energia de van der Waals em algoritmos genéticos para predição de estruturas de proteínas, Mestrado, 2010

Rondina, Gustavo Garcia. Novas ideias para o Método de Basin-Hopping Monte Carlo aplicado à otimização global de Clusters e Nanopartículas [online]. São Carlos : Instituto de Física de São Carlos, Universidade de São Paulo, 2013. Dissertação de Mestrado em Física Aplicada. Disponível em:

Teses de Doutorado

Souza, Roberto Molina, Modelagem estatística em estudos de bioequivalência sob o enfoque Bayesiano Estudos das propriedades estruturais, eletrônicas e ópticas de óxidos transparentes condutores (em progresso)
http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/59/59135/tde-30032015-135811/pt-br.php
Trabalho desenvolvido durante o estágio doutoral do estudante Osamu Waseda (INSA-Lyon)

Tese de Doutorado de Lucas Vieira Guerreiro Rodrigues Peres (IFSC-USP) doi: 10.11606/T.76.2014.tde-14102014-082328
Apoio projeto de doutorado de Gabriel Negrucci Dragone (bolsa CAPES)

Outros projetos da tese de doutorado estão sendo realizados no Blue Gene, entre eles, o projeto em parceria com o Fritz-Haber Institute da Sociedade Max Planck, Berlim, Alemanha, como parte da Bolsa de Estágio e Pesquisa no Exterior (BEPE) da FAPESP.

Em andamento – início 2015 Nome: Rafael Costa Amaral; Título: Estudo da Adsorção de Glicerol Sobre Superficies Intermetalicas de Platina com Defeitos; ´ Instituição de origem: Instituto de Química de Sao Carlos, Universidade de São Paulo; Bolsa: CNPq.

Em andamento – início 2015 Nome: Larissa Zibordi Besse; Título: Estudo da Adsorção de ˜ Agua, Etanol, e Derivados sobre Clusters de Metais de Transição Suportados sobre Oxidos Catalisadores; Instituic¸ ´ ao de origem: Instituto de Quimica de Sao Carlos, Universidade de São Paulo; Bolsa: CAPES.

Em andamento – início 2013 Nome: Fernando Pereira Sabino; Título: Estudo das Propriedades Estruturais, Eletronicas e Opticas de ´ Oxidos Transparentes Condutores (Al2O3 , Ga2O3 , In2O3 , e Multicompostos) Utilizando a Teoria do Funcional da Densidade; Instituição de origem: Instituto de Física de Sao Carlos, ˜ Universidade de Sao Paulo; Bolsa: CAPES; Orientador, Co-orientador: Luiz ˜ Nunes de Oliveira.

Em andamento – início 2013 Nome: Diego Guedes Sobrinho; Título: Estudo AbInitio dos Efeitos de Ligantes na Estrutura Atomica, Eletr ˆ onica, Estabilidade de ˆ Nanoclusters de Metais de Transic¸ao; Instituic¸ ˜ ao de origem: Instituto de Química de Sao Carlos, Universidade de Sao Paulo; Bolsa: FAPESP;

Em andamento – início 2013 Nome: Celso Ricardo Caldeira Rego Título: Estudo da Adsorção de Clusters Metálicos sobre Grafeno; Instituic¸ ´ ao de origem: ˜ Instituto de Física de Sao Carlos, Universidade de Sao Paulo; Bolsa: CAPES; Co-orientador, Orientador: Luiz Nunes de Oliveira.

Em andamento – início 2012 Nome: Rafael Luiz Heleno Freire; Título: Modelagem Molecular de Ligas Metalicas em S uperficies de Metais de Transição Instituição de origem: Instituto de Física de Sao Carlos, Universidade de São Paulo; Bolsa: CAPES.

Concluído – início 2011 Nome: Anderson Silva Chaves; Título: Estudo Teorico ´ das Propriedades Estruturais e Eletronicas de Clusters de Metais de Transição; Instituição de origem: Instituto de Física de Sao Carlos, Universidade de Sao Paulo; Bolsa: CNPq.

Daniel Rodrigo Ferraz Bonetti, Algoritmos de Estimação de Distribuição para Predição Ab Initio de Estruturas de Proteínas, Doutorado, 2015

Jean Paulo Martins, Análise da aprendizagem de ligações em otimização evolutiva, Doutorado, 2015

Antonio Helson Mineiro Soares, Algoritmos de estimação de distribuição baseados em árvores filogenéticas, Doutorado, 2014

Danilo Sipoli Sanches Algoritmos evolutivos multi-objetivo para reconfiguração de redes em sistemas de distribuição de energia elétrica, Doutorado, 2013

Márcio Kassouf, Crocomo Algoritmo de Otimização Bayesiano com Detecção de Comunidades, Doutorado, 2012

Christiane Regina Soares Brasil, Algoritmo evolutivo de muitos objetivos para predição ab initio de estrutura de proteínas, Doutorado, 2012

Franco-Soto, D.C. (2014). Modelos Birnbaum-Saunders para sobrevivência com dados longitudinais. Departamento de Estatística, Instituto de Matemática e Estatística, Universidade de São Paulo (coorientação com Antonio Carlos Pedroso de Lima)

Ricardo Oliveira dos Santos Soares, Processos preliminares da infecção viral: estudo estereoquímico da proteína E do Dengue, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto. Orientador. Prof. Dr. Antonio Caliri

Pós-Doutorado

Em andamento – in´icio 2014 Nome: Yohanna Seminovski Perez; Título: Uma Investigação Utilizando a Teoria do Funcional da Densidade da Interação Entre ˜ Agua e Etanol com Clusters de Metais de Transição Depositados sobre Dupercies de CeO2 (111); Instituição de origem: Instituto de Química de Sao Carlos, ˜ Universidade de Sao Paulo; Bolsa: FAPESP (24 meses).

Concluído – início 2015 Nome: Anderson Silva Chaves; Título: Estudo das Propriedades Estruturais e Electronicas de Nanoclusters Metálicos; Instituição de origem: Instituto de Química de Sao Carlos, Universidade de São Paulo; Bolsa: CNPq (10 meses).

Christiane Regina Soares Brasil, Supervisão de Pós-doutorado, 2013

Anderson da Silva Soares, Supervisão de Pós-doutorado, 2014

Rodrigo Antonio Faccioli, Supervisão de Pós-doutorado, 2014

Pesquisa em andamento

Processamento de dados magnetoteluricos e gravimétricos da bacia do Paraná (Projeto Temático da FAPESP 12/06082-6)

Eventos

Evento Macromolecular Crystallography School em 2014 e 2016

E.G. Melo, D.O. Carvalho, M.N.P. Carreño, and M.I. Alayo, “Slow Light Mach-Zehnder Electro-optic Modulator Based on Oxide-cladding Aluminum Nitride Photonic Crystal”. Apresentado em: OSA Latin America Optics & Photonics Conference (LAOP) 2016, Medellin (2016).

E.G. Melo, M.N.P. Carreño, and M.I. Alayo, “High-Q and Small Mode Volume Oxide-Cladding AlN Photonic Crystal Nanocavity”. Aprovado para apresentação em: Frontiers in Optics/Laser Science (FiO 2016), Rochester, NY, (2016).

Trabalhos em andamento ou em publicação

NMR Spin Relaxation of Water Confined in Calicte Slite Pores: a Molecular Dynamcis Study Sub 10 nm carbon nanotube field effect transistor

O trabalho com título “Density Functional Investigation of Ligand (PH3, SH2) Effects on the Structure Stability of the Au55 and Pt55 Nanoclusters” foi submetido na Journal of Physical Chemistry C (impacto 4.5) da American Chemistry Society, estando em fase de análise. Todos os cálculos foram realizados no Blue Gene. Outros projetos da tese de doutorado estão sendo realizados no Blue Gene, entre eles, o projeto em parceria com o Fritz-Haber Institute da Sociedade Max Planck, Berlim, Alemanha, como parte da Bolsa de Estágio e Pesquisa no Exterior (BEPE) da FAPESP.

Silva e Cunha (2016). A tabu search heuristic for the uncapacitated single allocation p-hub maximal covering problem. Artigo submetido para o European Journal of Operational Research. Bonassa e Cunha (2016).

Attilio Cucchieri (Sao Paulo U., Sao Carlos), Tereza Mendes (Sao Paulo U., Sao Carlos). , “Bloch Waves i n Minimal Landau Gauge and the Infinite-Volume Limit of Lattice Gauge Theory” a ser enviado para publicação ao Phys.Rev. D

Attilio Cucchieri (Sao Paulo U., Sao Carlos), Tereza Mendes (Sao Paulo U., Sao Carlos), “Further Study of BRST-Symmetry Breaking on the Lattice”,. a ser enviado para publicação ao PoS

Basso, L. G. M., Fernandes, T. V. A., Lima, J. F., Crusca, E., Vicente, E. F., Cilli, E. M., Pascutti, P. G., Costa-Filho, A. J. Structural plasticity of the putative fusion peptides from SARS-CoV spike glycoprotein and their interactions with model membranes.

Trabalho com título “Density Functional Investigation of Ligand (PH3, SH2) Effects on the Structure Stability of the Au55 and Pt55 Nanoclusters” foi submetido na Journal of Physical Chemistry C (impacto 4.5) da American Chemistry Society, estando em fase de análise. Todos os cálculos foram realizados no Blue Gene.

Cucchieri, Attilio e Mendes , Tereza, “Crossing the Gribov horizon: an unconventional study of geometric properties of gauge-configuration space in Landau gauge” a ser publicado nos anais PoS LATTICE2013 (2013)

Cucchieri, Attilio; Dudal, David; Mendes , Tereza, e Vandersickel, Nele , “BRST-Symmetry Breaking and Bose-Ghost Propagator in Lattice Minimal Landau Gauge” a ser submetido ao Phys. Rev. Lett.

Cucchieri, Attilio e Mendes , Tereza,, Numerical Evaluation of the Bose-Ghost Propagator in Minimal Landau Gauge a ser a ser submetido para publicação no Phys. Rev. D

Diego G. Sobrinho, Maurício J. Piotrowski, and Juarez L. F. Da Silva, The effects of environment effects in the stability of Pt and Au nanoclusters, manuscript in preparation.

Diego G. Sobrinho, Ricardo K. Nomiyama, Anderson S. Chaves, Maurício J. Piotrowski, and Juarez L. F. Da Silva, The stability of Platinum-based nanoalloys: A DFT investigation, manuscript in preparation.

Nardin, L. G.; Rosset, L. M. & Sichman, J. S. Adamatti, D. F.; Dimuro, G. P. & Coelho, H. (Eds.) Scale and topology effects on agent-based simulation: A trust-based coalition formation case study Interdisciplinary applications of agent-based social simulation and modeling, IGI Global, In the press